【2025年最新】給与ソフトと勤怠管理システムの連携ガイド｜効率化・ミス防止の決定版

はじめに

給与計算は企業運営において避けては通れない業務の一つです。しかし、従業員の労働時間や残業、有給休暇、深夜勤務手当など、様々な情報を手作業で入力し、計算するには膨大な時間と手間がかかります。また、ヒューマンエラーが発生すれば、従業員の信頼を損ねるリスクにもなりかねません。

こうした課題を解決するのが、「勤怠管理システムと給与ソフトの連携」です。両者を自動的に連携させることで、打刻データから勤怠集計、給与計算までを一気通貫で処理することが可能になり、大幅な業務効率化と人的ミスの防止が実現できます。

本記事では、勤怠管理と給与ソフトの連携によるメリット、具体的な連携方法、おすすめツールの比較、導入時の注意点までを徹底的に解説します。

なぜ勤怠と給与の連携が必要なのか？

勤怠管理と給与計算を別々に行っている場合、毎月の締日には以下のような作業が必要になります。

出退勤時間や残業、有休の取得状況をExcel等で集計
勤怠データを給与ソフトに手入力
計算結果を再確認・修正
ミスがあれば再集計・再入力

これらの作業は、担当者のスキルや注意力に大きく依存し、ミスの温床にもなりがちです。一方で、連携システムを導入すれば、勤怠情報をリアルタイムに給与ソフトへ自動連携することができるため、以下のような効果が得られます。

作業時間の大幅削減
ミスの防止・確認作業の軽減
労働時間や残業の集計精度向上
法令に基づいた自動計算機能の活用
ペーパーレス化の促進

これにより、人事・総務部門は単なる「作業部隊」から、「戦略的人事」に時間を使えるようになるのです。

勤怠管理と給与ソフトの連携方法とは？

連携方法は大きく分けて3つのタイプに分類されます。

① CSVファイルによる手動連携

もっとも基本的な方法です。勤怠管理システムからCSV形式で勤怠データを出力し、それを給与ソフトにインポートします。

メリット：初期コストが安い、導入が簡単
デメリット：毎回の手作業が必要、入力ミスのリスクあり

② API連携による自動連携

API（アプリケーション連携）機能を使って、勤怠データをリアルタイムで給与ソフトに自動連携する方法です。

メリット：完全自動化、リアルタイム連携、高精度
デメリット：対応ソフトが限られる、初期設定がやや複雑

③ オールインワン型システムの利用

勤怠・給与・人事などが統合されたシステムを利用するケース。クラウド型SaaSに多い形態です。

メリット：UIが統一されていて管理がしやすい、追加設定不要
デメリット：機能の柔軟性に欠ける場合がある、価格が高め

どの連携方法を選ぶかは、自社の人事業務体制や業務量、既存システムとの互換性によって判断する必要があります。

給与ソフト×勤怠管理システムの人気連携例

給与ソフト名	連携可能な勤怠システム	連携方法	特徴
マネーフォワード給与	KING OF TIME、ジョブカン	API・CSV	給与・勤怠・経費を一元管理
freee人事労務	チームスピリット、スマレジ勤怠	API	バックオフィス全体の自動化に強い
弥生給与	KING OF TIME、Touch On Time	CSV	中小企業に特化した操作性
SmartHR給与計算	SmartHR勤怠、ジョブカン	オールインワン or API	法改正対応とUIの分かりやすさに定評
給与奉行クラウド	KING OF TIME、Touch On Time	CSV・API	中堅〜大企業向けの高機能連携

このように、主要な給与ソフトは複数の勤怠システムとの連携を前提に開発されており、自社の既存環境に合わせた選択が可能です。

連携によって解決できる実務上の課題

勤怠と給与を連携させることで、次のような実務課題が解決されます。

締日前の“勤怠締め業務”がラクになる
　毎月のCSV集計や確認作業が数分で完了するようになります。
残業代・深夜手当のミスがゼロに近づく
　自動計算機能により、法定労働時間超過分も正確に反映。
有給管理の整合性が取れる
　取得日数・残日数が給与明細と連動し、不整合がなくなります。
支給・控除の自動処理が可能に
　勤怠データに基づく各種手当の自動付与・控除設定が可能です。

これにより、作業効率の向上と同時に「法令遵守」「社員との信頼関係構築」が同時に進みます。

連携トラブルを防ぐためのチェックポイント

便利な自動連携ですが、設定や運用が適切でないと逆にトラブルの原因にもなりかねません。以下の点を必ず確認しましょう。

勤怠締日と給与締日の整合性が取れているか
CSV出力フォーマットが給与ソフトと一致しているか
変更・修正時の反映フローは明確か
従業員マスタ（社員番号等）が統一されているか
勤怠データの確認者・承認フローが明確か

導入初期は、手作業による並行チェック期間を設けて運用の安定性を確認するのがベストです。

クラウド型連携システムの導入メリットとは？

クラウド型の給与・勤怠連携システムは、オンプレミス型（社内インストール型）に比べて以下のような利点があります。

バージョン管理・法改正対応が自動
　給与計算に関する法改正も自動でアップデートされ、常に最新の制度に準拠。
リアルタイムアクセスが可能
　管理者は出先でも給与データを確認・編集可能、在宅勤務にも最適です。
拠点・部門を超えた一元管理
　多拠点企業でも勤怠・給与を一元化してスピーディーに集計。
セキュリティ面も強化
　アクセス制限やログ管理など、多層的なセキュリティ設計で安心。

特に中小企業やスタートアップにとっては、クラウド型は初期投資を抑えつつも高機能を活用できる合理的な選択肢です。

導入フローと社内展開のポイント

給与ソフトと勤怠システムを連携させる際の導入ステップは以下の通りです。

現状課題の洗い出し（手作業・ミス箇所）
給与・勤怠の各ツール選定（既存環境との相性確認）
連携方式の確認（API or CSV）
トライアル期間で検証（並行運用）
正式導入と社内マニュアル作成
初回運用後にレビュー・改善

とくに重要なのは、「誰が設定し、誰が確認・修正し、誰が最終承認するのか」を明確にしておくことです。

まとめ

給与ソフトと勤怠管理システムの連携は、単なる業務の効率化にとどまらず、人事労務の品質向上・法令遵守・社員満足度の向上につながる戦略的な取り組みです。

2025年現在、多くの給与ソフトが勤怠システムとのAPI・CSV連携を強化しており、クラウド型を選べば初期導入のハードルも格段に下がっています。導入に際しては、自社の業務フローや人事リソースに合わせた設計が重要です。

これからの時代、「ミスのない給与計算」「人事労務のDX化」は企業の信頼性を左右する要素となります。この記事を参考に、自社に最適な連携方法を検討し、早期の導入を進めていきましょう。